נושא הפרוייקט
מספר פרוייקט
מחלקה
שמות סטודנטים
אימייל
שמות מנחים
שרת אינטרנטי עבור אינטרקציות של מולקולות miRNA mRNA
web server for miRNA mRNA-targets interactions
תקציר בעיברית
מיקרו-RNA (miRNA) הוא RNA לא מקודד עם 18-26 נוקלאוטידים. הוא מווסת את ביטוי הגנים באמצעות התחברות לmRNA ומייצר השפעות פיזיולוגיות ופתולוגיות משמעותיות. MiRNAs מקודדים בגנום והם מסונתזים על ידי גורמי חלבון אנדוגניים בעקבות תהליך רב שלבי. הם משנים את ביטוי הגנים ברמה על ידי יצירת רצפים היברידיים משלימים עם המטרות שלהם. הבנת תפקידם של מירנאים בתהליכים תאיים תלויה בזיהוי אתרי יעד ה-mRNA שלהם. מסד נתונים זה מספק תובנות חשובות לחוקרים החוקרים את היחסים והאינטראקציות בין אורגניזמים שונים, כולל הדמיות וכלי חיזוי. מטרת הפרויקט הסופית היא לבנות שרת אינטרנט חדש מבוסס למידת מכונה, miTargetBase, שיכול לזהות במהירות יעדי miRNA: מבוסס על שיטות ניסוי וחישוב כאחד. בנוסף, שרת האינטרנט יספק נתונים סטטיסטיים של הדמיית מסד נתונים, יחד עם שימוש במודלים של למידת מכונה לטובת מידע עבור אינטראקציות לא ידועות.
תקציר באנגלית
MicroRNA (miRNA) is a noncoding RNA with 18–26 nucleotides. It regulates gene expression through mRNA pairing and produces significant physiological and pathological effects. MiRNAs are encoded in the genome and are synthesized by endogenous protein factors following a multi-stage process. They modify gene expression at the post-transcriptional level by forming complementary hybrid sequences with their targets. Understanding the role of miRNAs in cellular processes depends on identifying their mRNA target sites. This database provides valuable insights for researchers studying the relationships and interactions between different organisms, including visualizations and prediction tools. The final project goal is to build a novel machine learning-based web server, the miTargetBase, which can rapidly identify miRNA targets: based on both experimental and computational methods. Additionally, the web server will provide database visualization statistics, along with the use of machine learning models for the benefit of information for unknown interactions.